Diferente de seu irmão gêmeo, Yukio, Rin Okumura nunca desejou saber sobre seus pais e as circunstâncias de seu próprio nascimento. No entanto, o mestre do tempo, Mephisto Pheles, dá a Rin uma chave que o transporta 40 anos para o passado, quando sua falecida mãe, Yuri Frederick Egin, era apenas uma criança. Com a orientação de Mephisto, Rin salta através dos anos da infância de Yuri e sua adolescência como uma aspirante a exorcista. Logo no início, Yuri conhece Shirou Fujimoto, o pai adotivo de Rin e Yukio. Enquanto Rin segue as vidas de Yuri e Shirou, ele testemunha em primeira mão as aparições iniciais de Satanás, seu verdadeiro pai, e os horrores se desenrolando na Seção 13, uma seção especial da Ordem da Cruz Verdadeira. A conexão única de Yuri com Satanás eventualmente leva Rin à verdade por trás do evento mais horripilante da história dos exorcistas e do dia em que ele e Yukio nasceram—a Noite Azul.