Cada episódio se concentra nas aventuras e desventuras de Nuku Nuku no ensino médio e em seu relacionamento com os alunos. O enredo geral da série se centra no esquema da maligna Mishima Industries para dominar o mundo através de seus produtos. Em oposição a este plano estão o ligeiramente maluco Kyuusaku Natsume e Nuku Nuku, a androide que atua como companheira de seu jovem filho. Os colegas de classe de Nuku Nuku são todos excêntricos; Futaba, a presidente de classe, é uma obcecada por controle dominadora que não consegue abrir mão de sua autoridade na escola. Chieko Shirakaba é a esnobe rica com as duas garotas bajuladoras que sempre ficam do seu lado. Há uma intelectual, uma mística, uma cientista e uma cantora pop. Todas elas são fiéis às suas descrições: a mística está sempre prevendo a desgraça por meio de cartas de tarô, espíritos ou alguma outra técnica oculta. A cantora pop nunca diz nada, exceto como uma canção. A intelectual está sempre com o nariz enfiado em um livro. Essas excentricidades aumentam o humor da série.