Através da longa dobra espacial chamada "Projeto Êxodo", Worns, Ryer e os outros membros da tripulação de "Watchers Nest" conseguem escapar da Terra. Misaki, que estava participando da batalha final com "Ghoul" naquela época, não está presente e, diante de seus olhos, a Terra muda e é cercada por uma barreira de tempo. Ryer e os outros procuram uma maneira de escapar deste labirinto espaço-tempo, mas a Terra muda para várias formas. Inúmeros "agoras" aparecem devido a diferentes eixos de tempo. E também Misaki, que deveria ter desaparecido por causa do incidente do Projeto Êxodo, ainda mais. Diante de Ryer e dos outros, diferentes formas de Misaki aparecem. A Misaki da escola de treinamento, a Misaki de sua infância. Esses são reflexos causados pelos conflitos que existem dentro de Misaki? Ela desperta uma segunda vez e quando ela obtém a resposta, essa história está levando a uma direção completamente diferente agora. Serão Misaki, Ryer e os outros capazes de encontrar um verdadeiro final feliz?!