No ano 2311 d.C., um mundo que antes via a si mesmo cheio de conflitos intercontinentais agora se encontra unificado, liderado pela Federação da Esfera Terrestre (FST). A FST estabeleceu uma força-tarefa militar preventiva conhecida como A-Laws, encarregando-os de desmantelar organizações terroristas violentas. À medida que ganham mais e mais autoridade legal, os A-Laws começam a distorcer a lei para se adequar à sua própria agenda, governando os cidadãos da Terra com mão pesada. Em resposta ao comportamento fascista dos A-Laws, o grupo antiterrorista Celestial Being reaparece. Liderados por mobile suits de última geração conhecidos como Gundam, os pilotos da Celestial Being travam uma nova guerra com os A-Laws, visando deter seu abuso tirânico de poder. Setsuna F. Seiei, piloto do Gundam Exia, ajuda a liderar o ataque juntamente com seus companheiros Gundam Meisters Lockon Stratos, Allelujah Haptism e Tieria Erde. Mas, no processo, Setsuna depara-se com uma conspiração liderada por uma nova facção, os Innovators, e deve lidar com suas próprias velhas feridas e fantasmas do passado para salvar um mundo que o despreza.