Traumatizado pela escola, Jun Sakurada passa seus dias em casa como um recluso, comprando coisas online, apenas para devolvê-las antes que o período de teste gratuito termine. Assim, quando uma nota aparece em sua mesa, perguntando se ele daria corda em algo, ele presume que era algo que ele havia encomendado e descuidadamente circula "sim", mudando sua vida para sempre. Uma caixa chega com uma boneca de corda dentro, mas este não é um brinquedo comum: depois que Jun lhe dá corda, ela começa a andar e falar como se fosse uma pessoa normal. Com uma atitude altiva, ela se apresenta como Shinku, a quinta boneca da coleção Rozen Maiden, um grupo de bonecas especiais feitas pelo lendário bonequeiro Rozen. Essas irmãs devem lutar umas contra as outras em uma competição chamada Alice Game com a ajuda de um humano para garantir a vitória. A vencedora se torna Alice, uma garota de verdade que é digna de conhecer seu criador. À medida que mais bonecas sencientes acabam se instalando na casa de Jun, e uma inimiga do passado de Shinku faz sua aparição, a vida de Jun se torna muito mais complicada do que ele jamais pensou ser possível.